Надо показаться хирургу, определиться, что за "шишки". Если липомы, атеромы, фибромы (т. е. подкожные образования), надо убрать. Гарантий, что новые не появятся, нет. Профилактику подобных процессов пока не придумали. Но уже имеющиеся образования лучше убирать. Если это гигромы в зонах суставов, то это дело травматологов.